Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ME1P48163 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ME1P48163 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ME1P48163 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ME1P48163 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ME1P48163 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms