Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEDD4P46934 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEDD4P46934 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms