Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCAMP43121 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCAMP43121 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCAMP43121 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms