Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMPOP42166 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMPOP42166 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMPOP42166 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMPOP42166 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMPOP42166 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMPOP42166 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMPOP42166 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms