Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
APOBEC1P41238 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms