Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGDSP41222 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGDSP41222 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms