Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms