Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GJC1P36383 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GJC1P36383 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms