Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
THBS4P35443 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
THBS4P35443 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
THBS4P35443 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
THBS4P35443 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
THBS4P35443 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms