Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RPL9P32969 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPL9P32969 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPL9P32969 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms