Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA10P31260 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms