Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA5P30532 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms