Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP5DP30049 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP5DP30049 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms