Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PEX2P28328 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms