Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms