Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ITGA3P26006 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ITGA3P26006 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms