Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PTAFRP25105 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms