Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
S100A1P23297 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms