Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTLA4P16410 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTLA4P16410 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms