Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MUC1P15941 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MUC1P15941 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MUC1P15941 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MUC1P15941 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms