Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAV1P15498 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAV1P15498 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAV1P15498 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms