Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GLI3P10071 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GLI3P10071 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GLI3P10071 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLI3P10071 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLI3P10071 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLI3P10071 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLI3P10071 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLI3P10071 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GLI3P10071 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GLI3P10071 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GLI3P10071 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GLI3P10071 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms