Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VSIG8P0DPA2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VSIG8P0DPA2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms