Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC166P0CW27 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC166P0CW27 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms