Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MMP10P09238 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms