Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD4P09016 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms