Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RHOP08100 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RHOP08100 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RHOP08100 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHOP08100 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RHOP08100 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RHOP08100 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RHOP08100 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHOP08100 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms