Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLK3P07288 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLK3P07288 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLK3P07288 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLK3P07288 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLK3P07288 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLK3P07288 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLK3P07288 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLK3P07288 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
KLK3P07288 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms