Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEFMP07197 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEFMP07197 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEFMP07197 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEFMP07197 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms