Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK1P06493 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms