Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOC1P02654 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC1P02654 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC1P02654 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC1P02654 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC1P02654 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC1P02654 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC1P02654 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOC1P02654 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms