Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDX58O95786 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDX58O95786 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDX58O95786 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDX58O95786 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms