Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ITGA10O75578 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms