Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TIMM8AO60220 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TIMM8AO60220 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms