Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP9BO43861 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATP9BO43861 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms