Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SYNGR2O43760 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms