Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRPO00591 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRPO00591 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRPO00591 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms