Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HHLA1C9JL84 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms