Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CYSRT1A8MQ03 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CYSRT1A8MQ03 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms