Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC69A6NI79 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC69A6NI79 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms