Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMB4A4D0S4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMB4A4D0S4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms