Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF22A3QJZ6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms