Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC4A4Q9Y6R1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC4A4Q9Y6R1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms