Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EMILIN1Q9Y6C2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMILIN1Q9Y6C2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms