Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNX13Q9Y5W8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNX13Q9Y5W8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms