Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAF6Q9Y4K3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms