Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms