Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
THRAP3Q9Y2W1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms