Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIF3AQ9Y2N7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIF3AQ9Y2N7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms