Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FARSAQ9Y285 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms